Plateforme de séquençage de Lyon
ProfileXpert (www.profilexpert.fr) est une plateforme de génomique et microgénomique de l’Université Lyon1 rattachée à la SFR santé Lyon-Est (UCBL UMS 3453 CNRS – US7 INSERM).
Expertise
Ses activités se divisent en 3 parties :
- des prestations de service en génomique, transcriptomique, épigénomique, régulomique et métagénomique principalement par les technologies de séquençage nouvelle génération à destination des laboratoires publics ou privés ou des entreprises
- des projets de recherche et développements en partenariat avec des laboratoires académiques ou des sociétés privées (ANR, FEDER, FUI et projets européens)
- une activité de formation.
Equipements
- Séquenceurs MiSeq, NextSeq 500 et HiSeq2500 (Illumina), MinION (Oxford Nanopore)
- Microdissecteur laser PixCell II (Arturus)
- Analyse Cellules uniques : DEParray ( Silicon Biosystem) ; C1 single cell autoprep system (Fluidigm)
- 2 stations Affymetrix et 1 station Iscan (Illumina)
- 1 serveur HP (calculs)
Principales réalisations
La plateforme est spécialisée dans les études de génomique, transcriptomique, épigénomique et métagénomique (microbiome, virome, fungiome) à partir de microquantités de matériels biologiques. Les échantillons peuvent être issus de tri par FACS ou par microdissection laser ou à partir de cellules uniques. La plateforme est également spécialisée dans l’analyse d’échantillons dégradés (FFPE, tissus infectés désactivés chimiquement ou par la chaleur).
Certification / Assurance qualité
La plateforme est certifiée ISO 9001 et NFX 50-900 et d’autre part autorisée MOT (autorisation donnée par l’ANSM pour manipuler des produits de microorganismes pathogènes et toxines).
Labels
IBISA
Responsables de la Plateforme
Joël Lachuer, PhD
Directeur de la plateforme
Faculté de Pharmacie de Lyon,
8 avenue Rockefeller
69 373 Lyon Cedex 08 – France
Contacts
En savoir plus
