Plateforme de séquençage de Paris – iGenSeq ICM
iGenSeq est une plate-forme technologique accessible à la communauté scientifique comprenant des laboratoires universitaires, des services hospitaliers et des partenaires industriels.
Située à l’Institut du Cerveau de Paris (ICM) sur le site de l’Hôpital Pitié-Salpêtrière à Paris, la plateforme fournit à ses utilisateurs des outils et des services pour l’analyse des acides nucléiques.
Créé en 2011 à l’ouverture de l’Institut, elle s’est spécialisée dans les prestations de séquençage haut débit et a évolué pour répondre aux projets de pointe en génomique
L’équipe est composé de 8 permanents (6 ETP) ce qui garantit la pérennité du savoir-faire et de l’expertise. Toutes les activités d’iGenSeq sont sous la responsabilité d’au moins 2 opérationnels, afin de maintenir une continuité permanente des services
Expertise
iGenSeq donne accès à des technologies et services génomiques de pointe incluant le séquençage à moyen et haut débit des acides nucléiques, ainsi que la PCR quantitative en temps réel (1 à 9216 reaction/run), la droplet digital PCR et la plateforme 10X Chromium pour le séquençage de cellules individuelles.
Nous proposons aussi un service de séquençage ready-to-load pour les utilisateurs qui réalisent eux même leurs banques.
- Genome
- Exome
- MethylSeq
- ChIP-Seq
- ATAC-Seq
- RNAseq
- miRNAseq
- ARN avec ribodéplétion…
- PCR quantitative en temps réel (qPCR)
- Droplet digital PCR (ddPCR)
Equipements
- 1 Novaseq 6000 Illumina, 1 Nextseq 500 Illumina, 1 MiSeq Illumina,
- 1 Chromium controller 10X genomics
- 1 LightCycler 96 et 384 Roche
- 1 Biomark HD Fluidigm
- 1 Droplet Digital PCR Biorad
Certification / Assurance qualité
iGenSeq est certifiée ISO9001 depuis 2015.
Labels
La plateforme a été labélisée IBISA en 2021
Responsables de la Plateforme
Yannick MARIE
Institut du Cerveau – ICM
Hôpital Pitié Salpêtrière
47, bd de l’hôpital
75013 PARIS – France