Plateforme de bio-informatique de Lille
Bilille est la plateforme de bioinformatique et de biostatistique de Lille au sein de l’UAR 2014 – US 41 Plateformes Lilloises en Biologie et Santé. Elle est également membre de l’Institut Français de Bioinformatique. Son expertise transverse et diversifiée dans l’analyse de données issues des domaines de recherche en biologie, environnement et santé lui permet d’offrir une palette de services diversifiés, du conseil à la production de résultats dans les projets, suivant les besoins.
Le périmètre scientifique de Bilille couvre notamment : l’analyse de données omiques, l’annotation de séquences, la biologie intégrative, la biologie des systèmes, la phylogénie, la bioinformatique structurale, l’analyse de données de criblage à haut contenu et l’analyse de données d’imagerie.
Equipements
Bilille offre des moyens de calcul à haute performance sous la forme d’un cloud, ouvert à tous les personnels académiques de la métropole lilloise ayant des besoins en ressources de calcul pour la bioinformatique. Ces moyens sont hébergés au sein du Mésocentre de l’Université de Lille.
Il s’agit d’un cloud openstack disposant de :
- 225 coeurs CPUs, 4 To RAM, 100 To stockage, réseau 10 Gbs dédiés
- 96 coeurs CPUs, 720 Go RAM intégrés à la fédération nationale Biosphère (IFB)
Principales réalisations
- visCorVar, package R pour la visualisation des résultats d’intégration de données multi-blocs (https://bilille.univ-lille.fr/it-resources/software)
- Norine, ressource pour les peptides non ribosomiques (https://norine.univ-lille.fr/norine/)
- mirkwood, identification de microARN dans les génomes de plantes (https://bioinfo.univ-lille.fr/mirkwood/)
- MATAM, assemblage ciblé de métagénomique (https://bioinfo.univ-lille.fr/matam/)
- SortMeRNA, tri et alignement de lectures de marqueurs conservés en métagénomique (https://bioinfo.univ-lille.fr/sortmerna/)
- RNAspace, plateforme d’annotation des ARN non-codants (http://www.rnaspace.org/)
Formations
Bilille organise des formations en bioinformatique et en biostatistique en lien avec les services de formation continue du CNRS, de l’Université de Lille et de l’Inserm. Des formations dédiées aux doctorants du collège doctoral de l’Université de Lille sont également proposées. Des journées scientifiques et des séminaires techniques ouverts à tous sont organisés tout au long de l’année.
Mise à jour Janvier 2025
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Labellisation IBiSA
Responsables de la Plateforme
Responsable scientifique : Guillemette Marot
Responsable technique: Jimmy Vandel
Bilille vous accueille sur 3 sites :
- Bâtiment ESPRIT, avenue Paul Langevin, 59650 Villeneuve-d’Ascq
- Bâtiment Plateformes-Cancer, 1 Pl. de Verdun, 59000 Lille
- Campus Pasteur Lille, 1 Rue du Professeur Calmette, 59000 Lille
Tutelles
Université de Lille, CNRS, Inserm, Institut Pasteur de Lille, CHU
Contacts
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