AOZAN: AN AUTOMATED POST-SEQUENCING DATA-PROCESSING PIPELINE
Aozan a été développé par GenomiqueENS, la plateforme génomique de l’IBENS (Institut de Biologie de l’École normale supérieure). Ce logiciel améliore la gestion des données de séquençage et le contrôle de la qualité grâce au suivi des statistiques des runs de séquenceurs Illumina. Le monitoring est assuré par des courriels automatiques et des rapports au format HTML.
Aozan : an automated post-sequencing data-processing pipeline. (2017) Perrin S. et al. Bioinformatics 33(14) doi.org/10.1093/bioinformatics/btx154
Disponibilité et implémentation : Aozan est implémenté en Java et Python, hébergé par les systèmes Linux, et distribué sous licence GPLv3.
Site web : http://www.outils.genomique.biologie.ens.fr/aozan/
Le code source d’Aozan est disponible sur GitHub :
https://github.com/GenomicParisCentre/aozan
Contact : aozan@biologie.ens.fr