Le séquençage du Transcriptome
Le transcriptome représente l’ensemble des ARN présents dans une cellule à un instant donné. Il comprend les ARNm, ARNr ARNt ARNnc. Sa composition diffère selon le type cellulaire, l’état biologique et environnemental de la cellule au moment de la mesure/extraction.
Selon le protocole d’extraction de l’ARN, le séquençage (Fig1.) va permettre :
- l’analyse de l’expression différentielle des transcrits entre eux ou entre différentes conditions biologiques
- la détection de variants (SNP)
- l’identification de transcripts alternatifs (isoformes, gènes de fusion…)
- la découverte de nouveaux transcripts et ARNnc
- le suivi de la traduction (profilage ribosomique)
