Le séquençage du Regulome
Le régulome fait référence à l’interaction entre l’ensemble des composants régulateurs d’une cellule qui contrôlent l’état d’expression des gènes et de leurs isoformes, en fonction de leur localisation subcellulaire, de leur état tissulaire, de leur développement et de leur pathologie.
La régulation peut s’exercer à plusieurs étapes (Fig1.).
1- L’accessibilité de l’ADN pour la transcription des gènes dépend de facteurs qui peuvent modifier le compactage des 5 familles d’histones sur lesquelles s’enroule l’ADN (Tsompana & Buck 2014; Klein & Hainer 2020; Sati &Cavalli 2016).
2- Le niveau de méthylation de l’ADN (ajout/suppression de groupements CH3 sur la Cytosine) module la transcription des gènes.
3- Les protéines régulatrices (facteurs de transcription) ont la capacité de se lier de façon spécifique à de courtes séquences de DNA et de réguler de façon positive ou négative la transcription d’un gène.
4- Des interactions ARN-protéines (RNP : complexes ribonucléoprotéiques) agissent sur les mécanismes post-trancriptionnels comme l’épissage, stabilité des ARNs etc.
5- Différentes classes d’ARN non codants comme les petits et micro ARN peuvent intervenir dans l’épissage, la synthèse des ribosomes, la dégradation les ARNm, la répression de la traduction.
Tous ces mécanismes sont affectés par des facteurs environnementaux (alimentation, pollution, âge, stress, traitement médicamenteux etc.).
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