Les modalités de l'appel
Dans le cadre de sa mission de soutien à la communauté scientifique, FRANCE GÉNOMIQUE consacre une partie importante de sa capacité de séquençage et de traitement bio-informatique des données, ainsi que les expertises associées, à la réalisation de quelques grands projets ambitieux, à haute valeur ajoutée scientifique et à forte visibilité internationale
Des projets à grande échelle, des challenges technologiques
Ces projets seront soumis par des laboratoires de la Recherche Publique et seront réalisés par les plateformes nationales (Genoscope et CNRGH). Les projets peuvent également impliquer des laboratoires partenaires étrangers, notamment européens. Les coûts de fonctionnement de ces projets seront être pris en charge par FRANCE GÉNOMIQUE en partie ou en totalité.
NB : FRANCE GÉNOMIQUE souhaite ouvrir de nouveaux appels à projets pour les Grands Projets de Séquençage. Cependant, aucune date à ce jour ne peut être communiquée sur l’ouverture d’un nouvel appel à projets.
Cet appel concerne essentiellement des projets séquençage à très grande échelle provenant d’organismes présentant un intérêt majeur sur le plan scientifique, médical ou économique. Des projets impliquant des populations d’organismes (méta-génome, diversité biologique), projets de génomique environnementale et génomique des populations sont encouragés. Exceptionnellement des projets de plus petite taille pourraient être retenus s’ils nécessitent d’importantes capacités d’analyse bio-informatique, ou présentent des challenges technologiques particuliers.
Une collaboration avec le Genoscope ou le CNRGH
Les projets retenus seront développés en collaboration avec le Genoscope ou CNRGH dans le cadre d’une convention écrite. Les partenaires (collaborateurs et plateforme) définiront ensemble la stratégie la plus appropriée à la réalisation des projets ainsi que les conditions pratiques de déroulement du travail expérimental.
Les données résultant de cette collaboration seront détenues conjointement par les partenaires qui conviendront des modalités de diffusion et d’éventuelle prise de protection intellectuelle, en accord avec les instances de tutelle et les usages en vigueur dans la communauté scientifique. En particulier, les données seront mises dans le domaine public. Les séquences assemblées seront soumises dans les banques de données publiques conformément aux règles internationales, dans un délai à définir pour chaque projet.
Les critères d’évaluation
Les projets seront évalués en fonction de :
- leur intérêt scientifique ;
- leur degré de faisabilité ;
- leur impact sur la communauté scientifique nationale et internationale ;
- le contexte international
- la capacité des proposants à obtenir rapidement le matériel biologique nécessaire
- l’aptitude des proposants à s’investir dans l’analyse bioinformatique ;
- la capacité des proposants à exploiter et publier les résultats du projet.
Le comité scientifique d’évaluation des projets
Le comité scientifique d’évaluation des projets est composé du comité exécutif et de deux sous-comités (Génétique humaine & santé et Biodiversité). Il est responsable de l’évaluation et de la sélection des projets soumis à l’infrastructure par la communauté.
Composition du comité scientifique génomique humaine et santé
Président : Florent Soubrier
Génétique et maladies cardiométabolique
AP-HP INSERM ICAN, Paris
Corinne Antignac
Génétique et néphropathie
AP-HP INSERM, Paris
Olivier Delattre
Génétique et biologie des cancers
INSERM, Institut Curie Paris
Emmanuelle Genin
Génomique Fonctionnelle et Biotechnologies
INSERM CHU, Brest
Cécile Julier
Génétique des Diabètes
INSERM, Paris
Jocelyn Laporte
Médecine translationnelle et neurogénétique
IGBMC, Strasbourg
Jean-Jacques Panthier
Génétique fonctionnelle de la souris
Institut Pasteur, Paris
Antonio Rausell
Bioinformatique clinique
Institut Imagine INSERM, Paris
Richard Redon
Génomique et Bioinformatique Institut du thorax
INSERM CHU, Nantes
David Tregouët
Génomique et pathophysiologie des maladies cardiovasculaires
INSERM ICAN, Paris
Composition du comité scientifique génomique biodiversité
Président : Thierry Heulin
Génomique Microbienne
Institut de Biologie Environnementale et de Biotechnologie, CEA, Cadarache
Philippe Bertin
Génétique Moléculaire, Génomique et Microbiologie
Université de Strasbourg, CNRS, Strasbourg
Didier Boichard
Génétique animale et Biologie intégrative
INRA, Jouy en Josas
Dominique Brunel
Polymorphisme des génomes végétaux
INRA, Evry
Jean-Michel Claverie
Biostatistique, Genomique et Microbiologie
CNRS, Marseille
Jean-Michel Drezen
Biologie de l’insecte
CNRS, Tours
Christophe Hitte
Génétique et Développement
CNRS, Rennes
Daniel Kahn
Ecologie Microbienne
INRA, Lyon
Hélène Lucas
Génétique et amélioration des plantes
INRA, Paris
Emmanuelle Maguin
Microbiote intestinal
INRA, Paris
Manuel Michaël
Evolution
Institut de biologie, Sorbonne, Paris
Michel Gurvan
Génomique bactérienne
CNRS, Roscoff
Christophe Plomion
Ecologie et Génomique Fonctionnelle chez les arbres forestiers
INRA Bordeaux
Fabrice Roux
Génomique écologique de l’adaptation dans les communautés végétales
INRA, Toulouse
Jean-Luc Souciet
Génétique Moléculaire, Génomique et Microbiologie, Université de Strasbourg
CNRS, Strasbourg
Linda Sperling
Organisation, évolution et stabilité des génomes
CNRS, Paris
Alain Vignal
Génétique et physiologie des systèmes d’élevage
INRA, Toulouse
Michel Werner
Biologie des génomes
Institut Jacques Monod, Paris
Répondre à l'appel
Pas d'appel à projet en cours.
France Génomique souhaite ouvrir de nouveaux AAP Grands Projets de Séquençage.
Cependant, aucune date à ce jour ne peut être communiquée sur l’ouverture d’un nouvel AAP.
Les projets sont à soumettre en anglais, à l’aide du formulaire ci-dessous.
Pour soumettre un projet
Soumettez le formulaire surwww.ibisa.net/france-genomique
Calendrier
Le calendrier sera défini lors du prochain appel.
- Ouverture de l'appel : JJ/MM/AAAA
- Date limite d'envoi des propositions : mardi JJ MMM AAAA à minuit
- Les décisions seront annoncées courant MMM AAAA
Résultats des précédents appels à projet
Retrouvez le résultat des précédents AAP en parcourant la rubrique suivante: